Služby - Molekulární genetika

Translokace zahrnující fúzi genu EWS (22q12) a některého z partnerských genů je specifickým markerem Ewingova sarcomu (EWS) a primitivního neuroektodermálního tumoru (PNET).

Zhruba v 85% všech případů je detekována fúze s genem FLI1 (11q24) ze skupiny ETS transkripčních faktorů. V dalších 10 - 15% případů je nalézána fůze s genem ERG (21q22), blízkého příbuzného ETS genů. Minoritně jsou pak nalézány i další fúzní partneři ze skupiny ETS genů jako ETV1 (7p22), E1AF(17q21) a FEV(2q36) (translokace) a ZSG(22q12) (inverze).

Při této fúzi dochází ke spojení N-terminální aktivační domény genu EWS s C-terminální, DNA vazebnou doménou ETS genu. Vzniká tak aberantní, vysoce onkogenní protein, který váže ETS cílené geny a aktivuje je.

Přítomnost zlomu v oblasti genu EWS analyzujeme pomocí FISH za použití EWSR1 Dual Color, Break Apart Rearrangement Probe firmy Vysis/Abbott (tato próba neidentifikuje specifického translokačního partnera). U vzorku pozitivního na rearanži genu EWSR1 pozorujeme jeden žlutý, jeden červený a jeden zelený signál (obr. 1A). U negativního vzorku pak dva žluté signály (obr. 1B).

Obrázek 1
EWSR1

A) Jádro pozitivní na zlom genu EWSR1.

B) Jádro negativní na zlom genu EWSR1.