Služby - Molekulární genetika

Infekce virem hepatitidy C (HCV) je častou příčinou virového zánětu jater a celosvětově je infikováno cca 170 milionů lidí. U většiny nemocných (cca 80%) přechází HCV infekce do chronického stádia s rozvojem chronické hepatitidy a přibližně u třetiny těchto pacientů dochází k rozvoji cirhózy a hepatocelulárního karcinomu. Epidemiologické, virové a hostitelské faktory jsou asociovány s rozdíly v iniciální HCV „clearence“ nebo perzistenci infekce a dále s odpovědí na léčbu HCV infekce. Studie ukázaly, že silná imunitní odpověď proti HCV zvyšuje jak spontánní virovou „clearence“, tak i zvyšuje šanci na vyléčení chronické hepatitidy. Variace v genech zahrnutých v imunitní odpovědi tudíž mohou přispívat k potlačení infekce. Nedávné studie pak prokázaly, že SNP (single nucleotide polymorphism) 3 kilobase před genem IL28B, jež kóduje interferon -λ3, je asociován s odpovědí na léčbu HCV, přičemž rozdíl mezi jednotlivými genotypy je až dvojnásobný. Homozygot C/C má vyšší frekvenci „clearence“/nižší frekvenci perzistence než homozygot T/T popř heterozygot.

SNP rs12979860 genu IL28B zjišťujeme pomocí PCR a přímého sekvenování (viz  obr.1).

Obrázek 1
SNP rs12979860 v blízkosti genu IL28B

1. Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ, Heinzen EL, Qiu P, Bertelsen AH, Muir AJ, Sulkowski M, McHutchison JG, Goldstein DB. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance. Nature. 2009;461(7262):399-401.
2. Thomas DL, Thio CL, Martin MP, Qi Y, Ge D, O'Huigin C, Kidd J, Kidd K, Khakoo SI, Alexander G, Goedert JJ, Kirk GD, Donfield SM, Rosen HR, Tobler LH, Busch MP, McHutchison JG, Goldstein DB, Carrington M. Genetic variation in IL28B and spontaneous clearance of hepatitis C virus. Nature. 2009;461(7265):798-801.