Služby - Molekulární genetika

Translokace t(11,18)(q21;q21) je charakteristickým genetickým markerem MALT lymfomů. Důsledkem této translokace je fúze genů API2 a MALT1. Proteiny API2 a MALT1 jsou za normálních podmínek rychle degradovány, jejich společný chimerický transkript API2-MALT1 však zůstává stabilní. Zvýšená exprese API2-MALT1 kontinuálně stimuluje transkripční faktor NF?B, který byl popsán jako kandidátní protoonkogen u řady lymfomů.

Translokace t(11,18) je přítomna u více než jedné třetiny MALT lymfomů žaludku. Případy s translokací mají vyšší sklon k recidivám (cca 75 % recidivujících MALT lymfomů nese translokaci). Translokace se může vyskytovat i u MALT lymfomů jiné lokalizace než v žaludku, např. v plicní lokalizaci byla prokázána u více než poloviny případů, ve slinných žlazách jen v malém počtu.

Translokaci t(11,18) lze detekovat různými způsoby. První možností je RT-PCR průkaz přítomnosti fúzního transkriptu API2-MALT1. Druhou možností je detekce translokace pomocí FISH. V naší laboratoři provádíme interfázní FISH s komerčně dostupnou "break apart" sondou LSI® MALT1 (18q21) Dual Color, Break Apart Rearrangement Probe (Vysis/Abbott). Výsledkem hybridizace s touto sondou je u normálního jádra přítomnost dvou fúzních (žlutých) signálů indikujících dvě neporušené kopie genu MALT1. V abnormální buňce s translokací zahrnující region 18q21 pozorujeme jeden fúzní, jeden zelený a jeden červený signál.

FISH
Při FISH detekujeme pomocí MALT1 Dual Color, Break Apart Rearrangement Probe firmy Vysis/Abbott zlom genu MALT1 (tato próba neidentifikuje specifického translokačního partnera). U vzorku pozitivního na rearanži genu MALT1 pozorujeme jeden žlutý, jeden červený a jeden zelený signál. U negativního vzorku pak dva žluté signály (obr. 1). („dual color“ filtr)

Obrázek 1

1. Soukup J, Krsková L, Campr V. Nové pohledy na problematiku MALT lymfomu žaludku. Čes.-slov. patologie. 2003;3(39):120-5.
2. Izumiyama K, Nakagawa M, Yonezumi M, Kasugai Y, Suzuki R, Suzuki H, Tsuzuki S, Hosokawa Y, Asaka M, Seto M. Stability and subcellular localization of API2-MALT1 chimeric protein involved in t(11;18) (q21;q21) MALT lymphoma. Oncogene. 2003 Nov 6;22(50):8085-92.