Služby - Molekulární genetika

Translokace t(7;17)(p15;q21) je jedním z nejčastěji se vyskytujících molekulárních markerů endometriálních stromálních tumorů.

Translokace zahrnuje gen JAZF1lokalizovaný na chromozómu 7 a gen JJAZ1 (joined to JAZF1) (také SUZ12) umístěný na 17 chromozómu. Tyto geny náleží do rodiny „zinc-finger“ transkripčních faktorů. JJAZ1 je zároveň členem „polycomb group“ (PcG) proteinové rodiny, s nimiž tvoří komplexy, jež negativně regulují expresi homeotických genů během embryogeneze. Funkce genu JAZF1 je dosud nejasná, nicméně je známo, že kóduje transkripční korepresor, který se váže na „orphan“ jaderný receptor TAK1.

U chimérického genu dochází ke spojení N-terminální „zinc-finger“ domény genu JAZF1 se „zinc-finger“ doménami a doménou dávající signál k jaderné lokalizaci genu JJAZ1. Přesný mechanismus, jakým produkt tohoto genu působí v nádorové transformaci, není známý.

K detekci translokace t(7;17)(p15;q21) využíváme jednokolovou RT-PCR (obr. 1) s následným ověřením fúzního produktu pomocí přímého sekvenování (obr. 2).

Obrázek 1
Agarózový gel s fúzními produkty RT-PCR detekujícími translokaci t(7;17)(p15;q21). 1,3 – pozitivní vzorky, 2 – negativní vzorek, 4 – pozitivní kontrola, 5 – negativní kontrola, 6 – voda, 7 – marker.

Obrázek 2
Sekvenogram s vyznačeným místem fúze genů JAZF1 a JJAZ1.

1. Hrzenjak A, Moinfar F, Tavassoli FA, Strohmeier B, Kremser ML, Zatloukal K, Denk H. JAZF1/JJAZ1 gene fusion in endometrial stromal sarcomas: molecular analysis by reverse transcriptase-polymerase chain reaction optimized for paraffin-embedded tissue. J Mol Diagn. 2005;7(3):388-395. Review.
2. Koontz JI, Soreng AL, Nucci M, Kuo FC, Pauwels P, van Den Berghe H, Cin PD, Fletcher JA, Sklar J. Frequent fusion of the JAZF1 and JJAZ1 genes in endometrial stromal tumors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2001;98(11):6348-6353.
3. Nucci MR, Harburger D, Koontz J, Cin PD, Sklar J. Molecular analysis of the JAZF1-JJAZ1 gene fusion by RT-PCR and fluorescence in situ hybridization in endometrial stromal neoplasms. Am J Surg Pathol. 2007;31(1):65-70.